热处理是出口实木托盘最常用的除害方式，目的杀灭木材内部蛀虫、虫卵及有害生物，满足国际检疫标准。整套流程需要将木材送入专用热处理窑，按照规定升温、保温，保证木材芯部温度达标并维持足够时长，不能只看窑内空气温度。
升温速度不宜过快，避免板材内外温差过大，出现开裂、翘曲变形。保温完成后，控制降温节奏，缓慢回落温度，稳定木材含水率。处理完成后，托盘按要求施加专用标识，标识清晰牢固，不能模糊、磨损。
热处理后的托盘需要单独存放，和未处理木料分区隔离，防止二次交叉带虫。加工环节要做好台账记录，留存处理参数。相比熏蒸方式，热处理无化学药剂残留，适用范围更广，也减少药剂对货物造成污染的隐患。